A organização do fundo obedece a um sistema de classificação orgânico-funcional, estabelecido de acordo com os princípios da proveniência e do respeito pela ordem original, elaborado com base na documentação do fundo.
O quadro de classificação é composto pelas seguintes secções e séries:
Secção A - Administração escolar
Série A/1 - Diários de frequência escolar do sexo feminino
Série A/2 - Diário de frequência escolar do sexo masculino
Série A/3 - Diário de frequência escolar misto
Série A/4 - Registo de matrículas, frequência e resultados da escola masculina
Série A/5 - Registo de matrículas, frequência e resultados da escola feminina
Série A/6 - Processos de Matrículas
Série A/7 - Relação das crianças em idade escolar
Série A/8 - Transferência de alunos
Série A/9 - Recenseamento escolar
Série A/10 - Aprovações e reprovações
Série A/11 - Impressos
Série A/12 - Correspondência expedida
Série A/13 - Correspondência recebida
Série A/14 - Gestão de alunos, docentes, edifícios e escolas
Série A/15 - Inventários
Série A/16 - Atas das reuniões do Jardim de Infância
Série A/17 - Visitas dos serviços de inspeção e disciplinares
Secção B - Caixa escolar
Série B/1 - Estatutos
Série B/2 - Receita
Secção C - Cantina escolar
Série C/1 - Atas
Série C/2 - Caixa
Série C/3 - Inventário
Série C/4 - Mapas destinados à assistência escolar