A Comissão Científica correspondia a um órgão técnico e consultivo e era constituída apenas por professores doutorados. De entre estes, era eleito um presidente, ao qual competia a convocação e a presidência das reuniões e a representação da Comissão junto da Direção. Competia-lhe à Comissão Científica:
“a) Propor cursos, estudos e atividades de investigação;
b) Avaliar os cursos e as atividades científicas promovidas pelo INESLA;
c) Dar parecer sobre os planos de atividades e orientação estratégica;
d) Dar parecer sobre propostas de cursos e de outras atividades;
e) Dar parecer sobre a contratação de especialistas;
f) Dar parecer sobre planos de aquisição de material bibliográfico.